Вода у річці Південний Буг за основними показниками забруднення не перевищує гранично допустимих норм. Єдине, що спостерігається кожного літнього сезону - "цвітіння" води. Це явище викликане масовим розвитком ціанобактерій через високі температури. Цвітіння призводить до зниження рівня кисню в воді, а це, в свою чергу, до мору риби.